Es gab "früher" einmal Festplatten, da wurde der Lesekopf bei Stromausfall (rein mechanisch durch die noch vorhandene Rotationsenergie der Platten) außerhalb des Plattenstabels auf eine Art Rampe geparkt. um ein mechanisches Aufsetzen der Leseköpfe auf den Platten zu verhindern. Das Geräusch war damals ähnlich.
Irgend einen ähnlichen techn. Vorgang wird es aber auch bei modernen Platten geben - also den Kopf irgendwie zu parken, wenn die Platte quasi im "Tiefschlaf" ist.
Bei (guten...) Serverfestplatten sind die unterschiedlichen Schlafzustände der Festplatten (ggf. mit einer externen Software) meist konfigurierbar, ob das bei Deinen Platten auch machbar ist (also quasi, tiefster Schlafzustand ist: Platten rotieren weiter/Kopf wird nicht geparkt, alles andere schläft...) müßtest Du einmal er-googlen.
Gut möglich, daß es auch direkt vom Board per BIOS/EFI beeinflußt wird, manche Boards haben da etwas eigenwillige Auslegungen der C-States, so etwas z.B.: bei C6 wird nach x Sekunden auch die Platte in den den "tiefsten Tiefschlaf" versetzt. Man(n) könnte da z.B. am Board erst einmal bewußt alle Energiespar-Funktionen ausschalten, damit dann testen, ob das Verhalten noch so "kreischig" ist und sich dann schrittweise wieder runter arbeiten.
Zusätzlich arbeiten die Platten bei Dir in einer Emulation der Emulation der Emulation... Gut möglich, daß dazwischen auch etwas hängen bleibt. Deshalb gibt es ja bei Serverplatten die o.g. Konfigurationsmöglichkeit, weil so etwas eben extrem schwer nach zu verfolgen ist. Auch einen Bug im DSM kann man an so einer Stelle durchaus erwarten...
Um es kurz zu machen: es wird wohl sehr schwierig, Dir hierzu per Forum (könnte/müßte/würde...) wirklich real zu helfen?!