He cargado el nuevo XPEnoboot 5.2-5565.2 como bootloader sustituyendo la anterior version DSM 5.1 - 5055 NAS DS3615xs en virtualbox y todo bien. desde hace 2 días funcionando todo perfecto, ha respetado toda la configuración, programas y archivos.
Hoy mismo incluso he actualizado a la ver. DSM 5.2-5565 Update 2 sin ningún problema. Eso si... siempre que la versión de NAS sea la misma, en mi caso DS3615xs, ya que cuando he realizado la misma operación desde DSM 5.1 - 5022 NAS DS3612xs a DSM 5.2 - 5565 NAS DS3615xs ha dado problemas la migración y ha terminado cascando.