Sí
Aún no lo he probado, pero debería funcionar, a ver si tengo tiempo y lo hago. También vi un script para usar Download Station por línea de comandos:
http://downloadstation.jroene.de/
Si funciona bien, se puede usar para pausar las descargas, cambiar el archivo .wgetrc para aplicar el límite de velocidad y volver a reanudarlas.
Al final la cosa quedaría así:
#!/bin/sh
downloadstation pause all
sleep 15
rm -f /root/.wgetrc
echo "limit_rate = 800k" >> /root/.wgetrc
sleep 15
downloadstation resume all
Así pausaría las descargas, esperaría 15 segundos, borraría el archivo /root/.wgetrc si existe, luego crearía un nuevo /root/.wgetrc con el limite, esperaría otros 15 segundos y reanudaría las descargas. Así no haría falta lo del archivo .wgetrcdia y .wgetrcnoche que era un aún más chapuza la verdad .
Saludos!