Не могу сказать как SHR ведет себя при переполнении, но если удастся что то забэкапить, то лучше это сделать.
Плохие новости это возможная физическая неисправность второго диска. Если форматирование не поможет и его статус с температурой не будет нормально отображаться, может потребоваться замена.