Ich hatte das auch, es kam die Fehlermeldung "Aktualisierung der Datei fehlgeschlagen. Die Datei ist vermutlich fehlerhaft.".
Dem Hinweis eines anderen Nutzers im englischen Update-2-Thread folgend, habe ich FixSynoboot.sh installiert.
Nach einem Neustart hat das Update ohne Probleme funktioniert.