Перепробовал все варианты настройки бэк-енда и php, никак не повлияло. И да, php у меня не используется.
Хосты одинаковые и на DSM 5.2 всё работало, так что точно не хосты.
Есть ощущение, что проблема как-то связана с правами на папку, но я уже все права дал и группе и пользователю http.
Ещё заметил, что если пойти по адресу mydomain.com/test, то файл открывается