С виндой машин в сети нет? Не верю! Вирус на винде какой-то в сети. Имея доступ к папкам он и создает весь этот мусор. Хранилищу этот вирус ничего не сделает, кроме как забьет весь диск под завязку своими копиями.
Решение:
Ограничить доступ учетных записей к папкам (временно)
Почистить антивирусом
Открыть доступ к одной папке (новой временной, положить туда пару папок, разрешения чтение-запись).
Посмотреть через денек на вирусы в этой папке и проверить по логу подключений кто подключался.
Я так в сетке на 300 компов определял источник распространения.
Сам DSM только в 4 версии имел какой-то вирус. На 5-й пока не было инцидентов.