Probablement qu'il va falloir réinstaller, surtout si c'est une "fresh install" car il ne me semble pas qu'il soit possible de sélectionner le disque pour le "supprimer". Par contre plutôt que de prendre le Jbod, personnellement je préfère prendre "volume simple" car certes il faudra répartir les données sur les deux disques, mais l'inconvénient du Jbod est que si un disque tombe en panne, l'ensemble des données devient inaccessible.
Sur google taper "synology choix raid" pour obtenir différents documents pour avoir d'informations sur le choix du raid en fonction de ses objectifs.